ภาพรวมของ Whole Exome Sequencing (WES)

Posted on
ผู้เขียน: Janice Evans
วันที่สร้าง: 25 กรกฎาคม 2021
วันที่อัปเดต: 15 พฤศจิกายน 2024
Anonim
Exome Sequencing | Whole Exome Sequencing | WES | Whole Exome Sequencing Analysis |
วิดีโอ: Exome Sequencing | Whole Exome Sequencing | WES | Whole Exome Sequencing Analysis |

เนื้อหา

Whole exome sequencing (WES) เป็นกระบวนการทางพันธุกรรมระดับโมเลกุลที่สามารถใช้เพื่อระบุการเปลี่ยนแปลงในยีน วิธีนี้เป็นวิธีที่ค่อนข้างใหม่และเนื่องจากเทคโนโลยีก้าวหน้าไปอย่างรวดเร็วจึงคาดว่าจะมีการวิจัยเพิ่มเติมและการค้นพบวัตถุประสงค์ทางคลินิกที่เป็นประโยชน์มากขึ้น

การทดสอบทางพันธุกรรมกำลังเป็นที่นิยมอย่างมากคุณสามารถซื้อผลิตภัณฑ์ที่ใช้ตัวอย่างเส้นผมหรือน้ำลายของคุณเพื่อระบุลักษณะทางพันธุกรรมบางอย่างและเรียนรู้ว่าชาติพันธุ์ใดเป็นส่วนหนึ่งของบรรพบุรุษของคุณ

WES แตกต่างจากการทดสอบทางพันธุกรรมประเภทนี้เล็กน้อยเนื่องจากใช้เพื่อระบุความผิดปกติใน ทั้งหมด ของยีนของคุณแม้ว่าความผิดปกติเหล่านี้จะไม่เคยเกี่ยวข้องกับโรคใด ๆ มาก่อน ตัวอย่างเช่นไม่ใช่การทดสอบที่ถูกต้องในการค้นหาความผิดปกติของยีนเฉพาะเช่นยีนที่ระบุว่าเกี่ยวข้องกับมะเร็งเต้านม

ยีนทำงานอย่างไร

WES สามารถใช้เพื่อค้นหารูปแบบเพื่อค้นหาสาเหตุทางพันธุกรรมของโรคทางการแพทย์ โครโมโซมของคุณคือโมเลกุลที่มีรหัสพันธุกรรมของคุณ (คุณมีโครโมโซม 23 คู่เรียกอีกอย่างว่าโมเลกุลของ DNA) ประกอบด้วยโมเลกุลของนิวคลีโอไทด์ที่มีเส้นยาว ร่างกายของคุณอ่านลำดับของนิวคลีโอไทด์บนโครโมโซมของคุณเพื่อผลิตโปรตีน


การเปลี่ยนแปลงของลำดับนิวคลีโอไทด์ในโมเลกุลของดีเอ็นเอทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงในลักษณะของพวกเราทุกคน

การเปลี่ยนแปลงที่ก่อให้เกิดโรคมักเรียกว่าการกลายพันธุ์

ช่วยให้เข้าใจพื้นฐานบางอย่างเกี่ยวกับพันธุศาสตร์หากคุณคิดจะใช้ WES

ยีนและจีโนม

ลักษณะร่างกายทั้งหมดของคุณเกิดจากการผลิตโปรตีน ยีนเป็นลำดับนิวคลีโอไทด์ที่เป็นรหัสสำหรับโปรตีนที่สร้างลักษณะของคุณ การเข้ารหัสทางพันธุกรรมทั้งหมดของโครโมโซม 46 ชิ้นของคุณเรียกว่าจีโนมของคุณ

รายละเอียดของยีนและดีเอ็นเอ

Exons

ส่วนของนิวคลีโอไทด์ของโมเลกุลดีเอ็นเอที่รหัสสำหรับยีนเรียกว่าเอ็กซอน พวกมันสลับกับอินตรอนซึ่งเป็นลำดับนิวคลีโอไทด์ที่ อย่าเขียนโค้ดสำหรับลักษณะ. ยีนเดี่ยวอาจประกอบด้วย exons หลายตัวซึ่งเป็นรหัสสำหรับโปรตีนหลายตัว Exons คิดเป็นเพียง 1 ถึง 2 เปอร์เซ็นต์ของ DNA ทั้งหมดของคุณ

แต่ละ exon เริ่มต้นด้วยลำดับนิวคลีโอไทด์ที่กระตุ้นให้การผลิตโปรตีนเริ่มต้นและจบลงด้วยลำดับนิวคลีโอไทด์ที่แจ้งให้ยุติการผลิตโปรตีน


Exome

เอ็กซอนทั้งหมดในชุดโครโมโซมทั้งหมดของคุณเรียกว่าเอ็กโซม การจัดลำดับจีโนมภายนอกทั้งหมดจะดูที่ exome ทั้งหมดของคุณเพื่อระบุความผิดปกติที่อาจทำให้เกิดโรคหรือปัญหาสุขภาพ

ข้อ จำกัด

WES ค่อนข้างกว้างขวางและตรวจสอบยีนทั้งหมดในร่างกายของคุณ อย่างไรก็ตามมันไม่ได้ตรวจสอบอินตรอนเลย เชื่อกันว่าอินตรอนอาจมีผลกระทบบางอย่างต่อร่างกายของคุณแม้ว่าผลกระทบดังกล่าวจะยังไม่เป็นที่เข้าใจและไม่คิดว่าจะมีอิทธิพลเท่ากับอิทธิพลของเอ็กซอน

กระบวนการ

WES ใช้ตัวอย่างเลือดเพื่อวิเคราะห์จีโนมของคุณ เซลล์ทุกเซลล์ในร่างกายของคุณมีโครโมโซมทั้งหมด 46 ชุดดังนั้นเซลล์เม็ดเลือดจึงเพียงพอสำหรับการทดสอบประเภทนี้

การทดสอบ WES ใช้เทคนิคระดับโมเลกุลที่เรียกว่าไฮบริดไดเซชันซึ่งเปรียบเทียบลำดับนิวคลีโอไทด์ของดีเอ็นเอตัวอย่างกับลำดับดีเอ็นเอมาตรฐานหรือ "ปกติ"

WES สามารถรับมือกับการกลายพันธุ์ที่เป็นที่ทราบกันดีอยู่แล้วว่าก่อให้เกิดโรคและยังสามารถตรวจจับการเปลี่ยนแปลงในรหัสพันธุกรรมที่ยังไม่เกี่ยวข้องกับโรคได้อีกด้วย


สถานที่รับการทดสอบ

มีห้องปฏิบัติการจำนวนมากที่ดำเนินการจัดลำดับ exome ทั้งหมด หากแพทย์ของคุณต้องการให้คุณมีการหาลำดับจากภายนอกทั้งหมดคุณอาจต้องเจาะเลือดที่สำนักงานแพทย์ของคุณและสามารถส่งตัวอย่างไปยังห้องปฏิบัติการเฉพาะเพื่อการตีความ

หากคุณได้รับการทดสอบโดยไม่ได้รับคำสั่งจากแพทย์คุณสามารถติดต่อห้องปฏิบัติการเฉพาะทางที่ทำการทดสอบ WES โดยตรงและขอคำแนะนำจากพวกเขา

ค่าใช้จ่าย

สิ่งสำคัญคือคุณต้องตรวจสอบค่าใช้จ่ายในการทดสอบและตรวจสอบด้วยว่าประกันสุขภาพของคุณครอบคลุมค่าใช้จ่ายในการทดสอบหรือไม่ WES เป็นเทคโนโลยีประเภทใหม่และ บริษัท ประกันภัยของคุณอาจหรือไม่ครอบคลุมค่าใช้จ่ายขึ้นอยู่กับนโยบายของพวกเขา

หากคุณวางแผนที่จะจ่ายเงินสำหรับการทดสอบด้วยตัวเองค่าใช้จ่ายอาจอยู่ระหว่าง 400 ถึง 1,500 เหรียญ

ข้อควรพิจารณา

หากคุณหรือบุตรหลานของคุณกำลังจะมีการจัดลำดับจีโนมทั้งหมดคุณจำเป็นต้องตระหนักถึงผลกระทบ มีหลายสิ่งที่ต้องพิจารณาก่อนดำเนินการ WES

ความเป็นส่วนตัว

ผลลัพธ์ทางพันธุกรรมของคุณอาจกลายเป็นส่วนหนึ่งของบันทึกทางการแพทย์ของคุณโดยเฉพาะอย่างยิ่งหากแพทย์สั่งการทดสอบของคุณและหากประกันสุขภาพของคุณจ่ายเงินให้ บริษัท ประกันสุขภาพของคุณ บริษัท ที่ทำการทดสอบและอาจเป็นผู้ขายของพวกเขา (หรือใครก็ตามที่แฮ็กเข้าสู่ระบบคอมพิวเตอร์ของพวกเขา) สามารถเรียนรู้ได้ว่าคุณมียีนสำหรับลักษณะทางพันธุกรรมที่รู้จักหรือไม่

เนื่องจากเป็นการทดสอบทางพันธุกรรมจึงมีผลกระทบที่อาจส่งผลกระทบต่อผู้ที่เกี่ยวข้องกับคุณเช่นกัน แม้ว่าจะมีกฎหมายคุ้มครองความเป็นส่วนตัวและข้อบังคับที่ป้องกันไม่ให้เงื่อนไขที่มีอยู่ก่อนส่งผลกระทบต่อความคุ้มครองสุขภาพของคุณ แต่ข้อมูลระดับนี้ก็ไม่เคยมีมาก่อน อาจมีผลลัพธ์ส่วนบุคคลและความเป็นมืออาชีพที่ไม่คาดคิดในแง่ของความเป็นส่วนตัว

การรับรู้ถึงความอ่อนแอของโรค

หลายคนมีความกังวลว่าการทดสอบจีโนมจะเปิดเผยเกี่ยวกับสุขภาพของพวกเขามากกว่าที่พวกเขาต่อรองไว้ในตอนแรก ยกเว้นในกรณีที่หายากมากเช่นการทดสอบทางพันธุกรรมของโรคฮันติงตันไม่ได้เปิดเผยอนาคตทางการแพทย์ของบุคคล

มีความเป็นไปได้ที่จะเปิดเผยในกรณีส่วนใหญ่ว่าบุคคลมีความเสี่ยงเพิ่มขึ้นสำหรับความผิดปกติทางการแพทย์ต่างๆ เนื่องจากบุคคลได้รับการทดสอบอย่างละเอียดจึงอาจมีการค้นพบความผิดปกติเล็กน้อย อย่างไรก็ตามหลายคนจะไม่นำไปสู่โรคหรือภาวะที่เฉพาะเจาะจง

ในขั้นตอนของการค้นพบนี้มีแนวโน้มว่าจะไม่มีใครสามารถแยกแยะได้ว่าผลกระทบทางการแพทย์ที่แน่นอนมีผลอย่างไรต่ออนาคตของบุคคลหรือ "ความผิดปกติ" ใดที่จะนำไปสู่โรคหรือภาวะบางอย่างเป็นต้น

การตัดสินใจในการทดสอบ

มีการทดสอบทางพันธุกรรมที่คล้ายคลึงกันหลายอย่างซึ่งประเมินโครโมโซมของคุณแตกต่างจาก WES และมีข้อดีและข้อเสียสำหรับการทดสอบแต่ละประเภท

การวิเคราะห์โครโมโซม

นอกจากนี้ยังมีการอธิบายการวิเคราะห์โครโมโซม karyotyping การทดสอบนี้สามารถวิเคราะห์โครโมโซมทั้งหมดของคุณเพื่อดูว่ามีการเปลี่ยนแปลงหรือไม่เช่นสำเนาโครโมโซมเพิ่มเติมหรือโครโมโซมที่ขาดหายไป

การทดสอบโครโมโซมยังสามารถตรวจพบการเปลี่ยนแปลงที่สำคัญของโครงสร้างโครโมโซมเช่นโครโมโซมที่ยาวหรือสั้น

Karyotyping สามารถระบุเงื่อนไขต่างๆเช่นดาวน์ซินโดรมซึ่งมีโครโมโซม 21 สำเนาเพิ่มเติมอย่างไรก็ตามไม่สามารถตรวจพบการกลายพันธุ์เล็ก ๆ ในยีนได้

ลำดับจีโนมทั้งหมด

ลำดับจีโนมทั้งหมดคล้ายกับการจัดลำดับเอ็กโซมทั้งหมดยกเว้นว่าจะกว้างขวางกว่า มันดูจีโนมทั้งหมดรวมทั้งลำดับอินตรอน การจัดลำดับจีโนมทั้งหมดมีค่าใช้จ่ายสูงกว่าการจัดลำดับแบบ exome ทั้งหมดเช่นกัน

การทดสอบทางพันธุกรรมระดับโมเลกุล

เรียกอีกอย่างว่าการทดสอบทางพันธุกรรม microarray การศึกษาเหล่านี้เปรียบเทียบส่วนเล็ก ๆ ของ DNA ของคุณกับยีนที่รู้จักหรือลำดับดีเอ็นเอที่เลือกเพื่อค้นหาการเปลี่ยนแปลงหรือการกลายพันธุ์ที่รู้จักในพื้นที่เฉพาะบนโครโมโซม

การทดสอบเหล่านี้มีประโยชน์หากคุณมีอาการของภาวะที่เกิดจากการกลายพันธุ์ในตำแหน่งที่ทราบของโครโมโซมเช่นยีนสำหรับโรคฮันติงตันและยีนมะเร็งเต้านมบางชนิด

คำจาก Verywell

WES ยังคงเป็นวิธีการทดสอบทางพันธุกรรมที่ค่อนข้างใหม่และยังไม่ชัดเจนว่าจะนำไปประยุกต์ใช้ในทางปฏิบัติได้ดีที่สุดอย่างไร

มีประเด็นสำคัญที่ต้องพิจารณาหากคุณหรือคนที่คุณรักกำลังได้รับการทดสอบทางพันธุกรรม หากการรักษาสภาพทางพันธุกรรมที่น่าสงสัยนั้นได้รับการปรับให้เหมาะกับความบกพร่องทางพันธุกรรมคุณอาจมีโอกาสได้รับมากมายจากการทดสอบ แม้ว่าการทดสอบจะไม่ส่งผลต่อการรักษาของคุณ แต่ผลลัพธ์อาจเป็นประโยชน์ในการทำความเข้าใจการพยากรณ์โรคของคุณและแจ้งให้สมาชิกในครอบครัวทราบว่าพวกเขาอาจมีความเสี่ยง อย่าลืมคิดอย่างรอบคอบว่าคุณจะตอบสนองต่อผลลัพธ์ที่ปกติหรือผิดปกติอย่างไรและพิจารณาความเป็นส่วนตัวของคุณอย่างรอบคอบก่อนทำการทดสอบ

การทดสอบจีโนมเผยให้เห็นโรคได้อย่างไร